De nouvelles variantes COVID dangereuses pourraient-elles évoluer chez les animaux de compagnie et les animaux de ferme ?

Les gens paniquent à propos du COVID-19 chez les animaux depuis le tout début de la pandémie. Il existe maintenant de nombreuses preuves que le SRAS-CoV-2 – le coronavirus qui cause le COVID-19 – peut passer de l’homme à d’autres animaux. C’est ce qu’on appelle le débordement. Le virus est capable d’infecter toute une gamme d’espèces, des hamsters aux gorilles.

Tiré de manitobacooperator.ca – par Sarah L. Caddy – Publié le 2 août 2021
| Traduction et adaptation libre par la rédaction |

Il est rassurant de constater que la grande majorité des animaux ne tombent pas aussi gravement malades d’une infection que les humains. De plus, à l’heure actuelle, il existe très peu de cas documentés d’animaux transmettant ensuite l’infection à l’homme. Mais une nouvelle préoccupation est maintenant en discussion : et si le SARS-CoV-2 pouvait se répliquer inaperçu chez les animaux et muter ? De nouvelles variantes pourraient-elles émerger qui peuvent réinfecter les humains et créer plus de ravages ?

Le SRAS-CoV-2 a évolué chez l’homme tout au long de la pandémie, entraînant l’apparition de nombreuses nouvelles variantes, et deux facteurs semblent avoir contribué à l’émergence de variantes. Le premier est le grand nombre d’infections chez les personnes dans le monde, car le virus a la possibilité de muter à chaque fois qu’il se reproduit. Le second est le nombre beaucoup plus petit d’infections chroniques qui surviennent chez les personnes dont le système immunitaire ne fonctionne pas pleinement. Face à un système immunitaire affaibli, le virus n’est pas rapidement éliminé et a donc le temps de développer des moyens d’échapper à l’immunité.

Est-il possible que ces scénarios d’évolution se produisent également chez les animaux, mais que nous ignorions qu’ils se produisent ?

Pour savoir s’il s’agit d’un risque, nous devons d’abord savoir combien d’infections surviennent chez les animaux. Cela aidera à identifier tout réservoir caché possible du virus. À cette fin, les infections par le SRAS-CoV-2 chez les animaux font l’objet d’études approfondies dans de nombreux endroits à travers le monde. Les scientifiques étudient exactement quelles espèces sont sensibles à l’infection, ainsi que la fréquence du virus dans différentes populations animales.

Pour savoir quelles espèces sont sensibles, de nombreux animaux différents – à la fois domestiqués et sauvages – ont maintenant été exposés au virus dans des cadres expérimentaux. Cela a permis de comprendre exactement quels animaux peuvent être infectés – ils comprennent les chats, les furets, les souris sylvestres et les cerfs de Virginie. Et pour découvrir à quel point les infections animales sont courantes, le dépistage des anticorps anti-SRAS-CoV-2 est également utilisé pour découvrir les animaux qui ont déjà été naturellement exposés au virus.

La plupart des études sur les infections naturelles chez les animaux se sont concentrées sur les chats et les chiens, car ce sont les espèces qui vivent le plus étroitement avec les humains. Une prépublication récente au Royaume-Uni (une recherche qui n’a pas encore été examinée par d’autres scientifiques) a révélé que seuls six des 377 chiens et chats de compagnie testés entre novembre 2020 et février 2021 avaient des anticorps spécifiques au SRAS-CoV-2.

Cela montre que l’infection n’est pas répandue et passe inaperçue chez la plupart de nos animaux de compagnie. Les premiers résultats d’une autre étude aux Pays-Bas (qui est également toujours en attente d’examen) ont révélé des taux d’anticorps plus élevés chez les animaux testés (54 sur 308 chiens et chats étaient positifs), mais probablement en raison de stratégies d’échantillonnage différentes. La recherche britannique a étudié des échantillons de sang provenant d’un ensemble aléatoire d’animaux, tandis que l’étude néerlandaise a spécifiquement échantillonné des animaux de compagnie au domicile de personnes connues pour être infectées par COVID-19.

Il est donc raisonnablement sûr de dire qu’il est peu probable que nos animaux de compagnie agissent comme un réservoir important d’infections en cours qui pourraient permettre l’émergence de nouvelles variantes. Mais qu’en est-il des autres espèces ?

L’animal le plus préoccupant est le vison. Les seuls cas documentés d’animaux transmettant le SRAS-CoV-2 à l’homme impliquent ces animaux. Ceux-ci ont été identifiés pour la première fois aux Pays-Bas en mai 2020 et des variantes liées au vison ont été identifiées au Danemark en novembre 2020. Heureusement, des mesures de confinement très efficaces ont rapidement maîtrisé les infections des visons dans ces zones – mais ces animaux devront continuer à être surveillés étroitement.

Qu’en est-il de l’autre source de variantes virales : les cas chroniques de COVID-19 ? Ceux-ci pourraient-ils se produire chez les animaux, permettant une plus grande évolution du virus au sein d’un seul hôte ?

En règle générale, les infections chroniques au SRAS-CoV-2 surviennent chez les personnes dont le système immunitaire ne fonctionne pas pleinement, souvent en raison d’autres problèmes de santé ou de traitements qu’elles reçoivent. Ces patients immunodéprimés reçoivent donc une prise en charge médicale étendue tout au long de leur infection.

Les animaux peuvent également être immunodéprimés pour toute une série de raisons, mais même les animaux de compagnie les plus aimés subissent rarement le type d’hospitalisation étendue qui pourrait permettre une évolution virale. Quant à l’immunosuppression chez d’autres animaux, tels que la faune sauvage, ce serait un inconvénient important pour la survie. Il est peu probable que des animaux dont le système immunitaire soit affaibli survivent assez longtemps pour qu’une grande partie de l’évolution d’un virus aigu comme le SRAS-CoV-2 se produise. Cependant, des mutations mineures ont été signalées dans des infections expérimentales (encore une fois dans les premières recherches en attente d’examen), suggérant qu’une certaine évolution est théoriquement possible même sur une courte période de temps.

À l’avenir, il est essentiel que nous continuions la surveillance du SRAS-CoV-2 dans toutes sortes de populations animales. Une attention particulière devrait être accordée aux animaux qui vivent plus étroitement avec les humains – ce sont les animaux de compagnie et les animaux d’élevage qui sont le plus susceptibles d’être accidentellement exposés à de fortes doses de virus provenant d’une personne infectée. Une attention particulière doit également être accordée à la faune connue pour être sensible à l’infection.

En cas de signes de propagation naturelle d’un animal à l’autre ou d’infections chroniques chez les animaux, des mesures de contrôle strictes doivent être mises en place rapidement. À l’heure actuelle, il n’est pas nécessaire d’envisager des stratégies de contrôle généralisées similaires pour les animaux comme celles utilisées chez les humains, mais nous devons garder l’esprit ouvert pour l’avenir.

Source : https://www.manitobacooperator.ca/comment/comment-could-dangerous-new-covid-variants-evolve-in-pets-and-farm-animals/